More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1587 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1587  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 835 aa  1674    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0088004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  55.77 
 
 		 636 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1301  transcriptional regulator, IclR family  60.61 
 
 		 880 aa  965    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  69.8 
 
 		 627 aa  788    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  50.72 
 
 		 632 aa  601  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1767  AMP-dependent synthetase and ligase  54.11 
 
 		 650 aa  595  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898058  normal  0.363453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2047  acetyl-coenzyme A synthetase  52.95 
 
 		 651 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  50.45 
 
 		 626 aa  577  1.0000000000000001e-163  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  51.79 
 
 		 629 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  49.83 
 
 		 632 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  50.36 
 
 		 631 aa  565  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  49.29 
 
 		 629 aa  555  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  49.65 
 
 		 629 aa  551  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  51.53 
 
 		 651 aa  550  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  48.57 
 
 		 632 aa  547  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  48.57 
 
 		 635 aa  545  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  49.49 
 
 		 655 aa  544  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  49.65 
 
 		 629 aa  538  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  48.4 
 
 		 631 aa  538  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  50.18 
 
 		 639 aa  538  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  49.64 
 
 		 639 aa  534  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  49.56 
 
 		 657 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  48.2 
 
 		 652 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  48.5 
 
 		 649 aa  526  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  48.58 
 
 		 664 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  48.58 
 
 		 664 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  47.37 
 
 		 625 aa  525  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  48.93 
 
 		 657 aa  521  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  48.65 
 
 		 648 aa  518  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  48.48 
 
 		 656 aa  518  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  47.58 
 
 		 655 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  48.48 
 
 		 655 aa  514  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  46.87 
 
 		 650 aa  511  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  49.63 
 
 		 656 aa  511  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  47.36 
 
 		 650 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  46.61 
 
 		 649 aa  511  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  47.69 
 
 		 656 aa  509  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  46.9 
 
 		 657 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  46.53 
 
 		 667 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  46.96 
 
 		 660 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  48.28 
 
 		 660 aa  505  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  47.24 
 
 		 661 aa  504  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  45.8 
 
 		 657 aa  501  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  45.34 
 
 		 666 aa  499  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  47.33 
 
 		 667 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  46.53 
 
 		 652 aa  498  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  47.92 
 
 		 643 aa  499  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  47.64 
 
 		 661 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  46.39 
 
 		 650 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  47.96 
 
 		 655 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  47.96 
 
 		 655 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  45.62 
 
 		 667 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  46.02 
 
 		 654 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  47.33 
 
 		 658 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  48.01 
 
 		 638 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  45.36 
 
 		 664 aa  493  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  46.1 
 
 		 658 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  46.18 
 
 		 655 aa  492  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  46.15 
 
 		 655 aa  489  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  45 
 
 		 657 aa  487  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  45.99 
 
 		 666 aa  488  1e-136  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  45.22 
 
 		 667 aa  486  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  44.78 
 
 		 653 aa  488  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  45.58 
 
 		 660 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  44.88 
 
 		 660 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  46.86 
 
 		 658 aa  487  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  46.48 
 
 		 663 aa  488  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  47.5 
 
 		 670 aa  487  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  46.96 
 
 		 659 aa  489  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  45.7 
 
 		 660 aa  485  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  44.62 
 
 		 632 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  44.8 
 
 		 631 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  44.62 
 
 		 631 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  44.05 
 
 		 660 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  46.69 
 
 		 649 aa  484  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  44.8 
 
 		 632 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1775  acetyl-CoA synthetase  45.52 
 
 		 660 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  46.25 
 
 		 656 aa  481  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  45.34 
 
 		 658 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  45.16 
 
 		 658 aa  482  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  46.36 
 
 		 649 aa  481  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  45.98 
 
 		 644 aa  482  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  46.31 
 
 		 660 aa  482  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  47.69 
 
 		 656 aa  481  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  46 
 
 		 657 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  44.89 
 
 		 667 aa  481  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  43.59 
 
 		 664 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  45.45 
 
 		 649 aa  478  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  44.2 
 
 		 660 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  46.06 
 
 		 660 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  46.02 
 
 		 673 aa  479  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0983  acetate/CoA ligase  45.15 
 
 		 665 aa  477  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  44.7 
 
 		 660 aa  479  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  46.53 
 
 		 660 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  45.88 
 
 		 664 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  46.85 
 
 		 661 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  44.64 
 
 		 666 aa  477  1e-133  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  45.88 
 
 		 660 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  45.5 
 
 		 660 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  45.9 
 
 		 715 aa  477  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>