More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4517 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 255 aa  513  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  54.04 
 
 		 336 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  52.99 
 
 		 245 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 247 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 247 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 247 aa  201  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 247 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  36.4 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3765  IclR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 246 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  37.18 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2930  regulatory proteins, IclR  34.75 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  34.58 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  34.17 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 		 281 aa  99  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 252 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  29.66 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  32.35 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.25 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  30.34 
 
 		 273 aa  85.5  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  29.2 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.18 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.91 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  28.7 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0152  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957112  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  27.12 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  28.44 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  28.15 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  26.46 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  26.97 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  26.46 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  26.46 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  27.63 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  27.02 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  26.89 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  27.12 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  25.94 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  29 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  26.69 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 273 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  30.34 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  26.47 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.11 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0203  IclR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.670577 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  26.34 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1454  IclR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0530  IclR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  28.26 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  26.61 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  28.71 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  26.69 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  26.24 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  26.69 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  25.62 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  26.69 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  26.69 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  26.69 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  25.54 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  26.69 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  26.16 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  27.8 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  26.27 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  26.27 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  26.27 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  26.46 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  26.27 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>