More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2600 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  56.79 
 
 		 254 aa  271  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  54.58 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  52.5 
 
 		 245 aa  234  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2930  regulatory proteins, IclR  46.09 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  40.08 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  35.29 
 
 		 245 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 247 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  34.58 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  34.22 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 257 aa  92  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  33.82 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  31.94 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  28.63 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  28.95 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0264  transcriptional regulator, IclR family  31.92 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  28.25 
 
 		 243 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 281 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.78 
 
 		 261 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.33 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  31.7 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  28.18 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  31.86 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3648  transcriptional regulator, IclR family  28.88 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  30.56 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  34.22 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  27.16 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  31.9 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  29.49 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  28.46 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  28.21 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  32.76 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  29.95 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  31.94 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 319 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.23 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  33.67 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  27.87 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  25.53 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5401  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  27.87 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  27.63 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  27.35 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  26.97 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  27.38 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  27.38 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  31.36 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  32.97 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  28.76 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  29.47 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  28.94 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.96 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  27.45 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  27.45 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>