233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5307 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  512  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5401  IclR family transcriptional regulator  73.17 
 
 		 260 aa  358  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  48.77 
 
 		 279 aa  232  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3258  IclR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0152  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957112  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  34.32 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 254 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1566  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1557  transcriptional regulator, putative  27.27 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0315  regulatory protein, IclR  36.13 
 
 		 279 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1527  regulatory proteins, IclR  27.87 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6484  regulatory protein, IclR  36.67 
 
 		 259 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476341  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  29 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  30.1 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  33.33 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  25.79 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  26.24 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3621  regulatory protein, IclR  31.67 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  26.42 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  25.42 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0970  IclR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  25.1 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  24.28 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.03 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  28.8 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0264  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  33.12 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0997  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  26.89 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4551  regulatory protein IclR  25.65 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  25.93 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  32.91 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0939  IclR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  23.81 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2422  IclR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  28.95 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  27.04 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  25.68 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  22.87 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0349  IclR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000127041  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  23.28 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  23.78 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  29.11 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  27.22 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  23.31 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  24.83 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  24.83 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  22.82 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3765  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 272 aa  52  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  21.25 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6385  transcriptional regulator, IclR family  21.76 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.040112  normal  0.0189266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3112  transcriptional regulator, IclR family  23.36 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2930  regulatory proteins, IclR  27.22 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  23.08 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  23.08 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>