More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1811 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 254 aa  499  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  56.79 
 
 		 249 aa  284  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  48.55 
 
 		 245 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2930  regulatory proteins, IclR  39.92 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  37.18 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  38.39 
 
 		 336 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  34.51 
 
 		 245 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3765  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0152  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957112  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  34.47 
 
 		 260 aa  88.6  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  28.39 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.75 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  32.64 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5473  regulatory protein IclR  27.95 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  30.32 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  26.05 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  30.7 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  30.94 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1929  transcriptional regulator, IclR family  29.71 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  29.28 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  29.91 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  27.71 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  29.56 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0264  transcriptional regulator, IclR family  29.11 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  25.74 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0920  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687031  normal  0.0182204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  28.26 
 
 		 266 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3648  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  28.33 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1022  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.767316  normal  0.65898 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  25.94 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  29.29 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  27.92 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  30.8 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0315  regulatory protein, IclR  26.41 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  31.31 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  30.64 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  28.89 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  28.37 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  24.65 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  31.39 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  29.3 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  27.27 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1566  IclR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207708  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  26.54 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1527  regulatory proteins, IclR  22.36 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>