More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3765 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3765  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
272 aa  553  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  41.96 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
247 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
247 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
247 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
247 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  38.14 
 
 
255 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
247 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
247 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  38.43 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  34.53 
 
 
243 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  33.18 
 
 
243 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2930  regulatory proteins, IclR  33.05 
 
 
243 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  31.8 
 
 
254 aa  95.5  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  31.22 
 
 
245 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
249 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  37.91 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  34.97 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  30.67 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  31.08 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  28.73 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  26.86 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  30.06 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  36.71 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  29.31 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  27.47 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  31.41 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  34.97 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  32.52 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  31.37 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  23.18 
 
 
252 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
251 aa  63.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  30.82 
 
 
251 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  32.65 
 
 
257 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  33.1 
 
 
260 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 
546 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  31.77 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  30.63 
 
 
294 aa  63.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
272 aa  62.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  32.47 
 
 
257 aa  62.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27090  transcriptional regulator  33.33 
 
 
268 aa  62.4  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  32.47 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.3 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  26.59 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  29.02 
 
 
287 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0697  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.734635  decreased coverage  0.00216711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1433  IclR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  25.43 
 
 
254 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  28.89 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
254 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
291 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
265 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 
257 aa  58.9  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
254 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  30.41 
 
 
279 aa  58.9  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.82 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3350  transcriptional regulator IclR  24.42 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
255 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2508  regulatory proteins, IclR  25.21 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.750932  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
259 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  25.97 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2705  regulatory proteins, IclR  28.37 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393671  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  28.1 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  25.97 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
280 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  28.25 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  23.95 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  23.78 
 
 
261 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3258  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  29.8 
 
 
254 aa  56.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1454  IclR family transcriptional regulator  22.15 
 
 
253 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
246 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 
265 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
288 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  31.03 
 
 
262 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0530  IclR family transcriptional regulator  23.02 
 
 
253 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>