More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6385 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6385  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.040112  normal  0.0189266 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0997  IclR family transcriptional regulator  68.13 
 
 		 264 aa  364  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0939  IclR family transcriptional regulator  67.33 
 
 		 264 aa  359  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4551  regulatory protein IclR  66.27 
 
 		 277 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0970  IclR family transcriptional regulator  63.49 
 
 		 258 aa  337  9e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2508  regulatory proteins, IclR  56.45 
 
 		 254 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.750932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2780  transcriptional regulator, IclR family  56.43 
 
 		 254 aa  291  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3087  IclR family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 254 aa  288  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0787215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3112  transcriptional regulator, IclR family  40.91 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6681  IclR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2705  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2989  regulatory protein IclR  30.86 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5093  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5802  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0468871 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6702  transcriptional regulator, IclR family  29.64 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.136407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.82 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  27.54 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  27.54 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  24.55 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  27.52 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  27.52 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  21.62 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4781  transcriptional regulator, IclR family  33.92 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  24.8 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  28.03 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4994  transcriptional regulator, IclR family  33.57 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0276676  normal  0.0169874 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.45 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  26.4 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2705  regulatory proteins, IclR  27.67 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  30.2 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  23.04 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13880  transcriptional regulatory protein, IclR family  28.14 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176969  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  23.94 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  24.12 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  24.37 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2422  IclR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  27.92 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  26 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  24.78 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  22.48 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  26.03 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  26.01 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  30.87 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  26.03 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  23.39 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2760  regulatory protein IclR  22.84 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5338  IclR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4749  IclR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5523  IclR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  28.77 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  25.83 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  24.78 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  23.81 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  24.15 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  25.11 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  22.69 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  22.87 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  28.97 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0217  transcriptional regulator, IclR family  28.87 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2459  IclR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  32.05 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  19.92 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4910  IclR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  28.57 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5724  transcriptional regulator, IclR family  23.29 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  22.58 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04160  transcriptional regulator, IclR family  27.59 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  22.58 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  24.47 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  24.66 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  24 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  30.7 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>