More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0970 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0970  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4551  regulatory protein IclR  71.43 
 
 		 277 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6385  transcriptional regulator, IclR family  63.49 
 
 		 261 aa  337  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.040112  normal  0.0189266 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0997  IclR family transcriptional regulator  62.8 
 
 		 264 aa  335  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0939  IclR family transcriptional regulator  62.4 
 
 		 264 aa  332  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2508  regulatory proteins, IclR  55.69 
 
 		 254 aa  291  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.750932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2780  transcriptional regulator, IclR family  54.47 
 
 		 254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3087  IclR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0787215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3112  transcriptional regulator, IclR family  38.59 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6681  IclR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2705  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2989  regulatory protein IclR  33.92 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5093  transcriptional regulator  30.45 
 
 		 275 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5802  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0468871 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6702  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.136407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  21.74 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  25.83 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  25.58 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  25.58 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  23.74 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  24.77 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  23.69 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  24.2 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  24.2 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  25 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  22.33 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  26.53 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  25.22 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  21.37 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1534  regulatory protein, IclR  23.17 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  27.87 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  22.75 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  24.53 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  22.58 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  24.53 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  26.19 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  23.15 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  22.97 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  22.97 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4941  putative IclR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  19.57 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  24.06 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  26.49 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  24.49 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  25.3 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  22.18 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  25.12 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4994  transcriptional regulator, IclR family  29.79 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0276676  normal  0.0169874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  24.44 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  19.55 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  22.94 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  23.14 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  23.79 
 
 		 324 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  24.49 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  24.69 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  22.08 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  24.43 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  22.86 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  22.08 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  25.61 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2459  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  24.49 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  25.11 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  21.27 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  22.94 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  25.66 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  20.74 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  24.07 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  20.28 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>