More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1344 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1344  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  528  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.491684  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3604  IclR family transcriptional regulator  45.2 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.83328  normal  0.323087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1546  IclR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00070993  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3645  IclR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5473  regulatory protein IclR  36.99 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2369  regulatory proteins, IclR  34.92 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  36.19 
 
 		 262 aa  142  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0318  regulatory proteins, IclR  36.8 
 
 		 287 aa  131  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000583044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6477  regulatory protein, IclR  33.47 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  35.38 
 
 		 274 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7060  IclR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.579294  normal  0.280018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  34.35 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  31.37 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  35.32 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  32.51 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 275 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.84 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.84 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.84 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.84 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3045  transcriptional regulator IclR  27.78 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  32.86 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.36 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  32.02 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  32.02 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  30.34 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  29.08 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  30.18 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.27 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 254 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  30.18 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  29.25 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  30.54 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  27.59 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.45 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  30.47 
 
 		 268 aa  99.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  32.62 
 
 		 268 aa  98.6  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 601 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.19 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  29.05 
 
 		 279 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  29.95 
 
 		 269 aa  95.5  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  29.11 
 
 		 258 aa  95.1  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  26.6 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 549 aa  95.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  28.38 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  29.3 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4304  transcriptional regulator, IclR family  28.64 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4414  transcriptional regulator, IclR family  28.64 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  25.98 
 
 		 260 aa  92  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  28.22 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>