More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4050 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4050  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 262 aa  513  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4448  IclR family transcriptional regulator  92.28 
 
 		 260 aa  478  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5944  transcriptional regulator, IclR family  55.37 
 
 		 268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38610  transcriptional regulator  35.5 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0846  transcriptional regulator, IclR family  36.16 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.731072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3768  regulatory proteins, IclR  35.38 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000320776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1748  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21340  transcriptional regulator  33.05 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  30.84 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0663  transcriptional regulator, IclR family  28.28 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0572  transcriptional regulator, IclR family  28.78 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  31.34 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0897  regulatory proteins, IclR  27.27 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.54 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1951  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0578  IclR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.64 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.14 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  26.34 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24.42 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  28.03 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  28.52 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  29.77 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  22.39 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  25.65 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.82 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  28.09 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  23.92 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  31.07 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  28.44 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1929  transcriptional regulator, IclR family  26.86 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  26.97 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  27.38 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  24.77 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  24.5 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  24.21 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  28.35 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  27.24 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  27.24 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  28.37 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0896  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 91 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  25.13 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  33.17 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  29.67 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  28.68 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  25.23 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  25.71 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  23.94 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  24.41 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  27 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  24.48 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  24.48 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  24.48 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  23.97 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  23.97 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  23.97 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  25.88 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  23.97 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  30.39 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  23.97 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>