More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0897 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0897  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1748  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 247 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21340  transcriptional regulator  37.75 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3768  regulatory proteins, IclR  39.41 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000320776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0846  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.731072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38610  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 268 aa  85.1  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  31.75 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  29.73 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4448  IclR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  28.33 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0663  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1951  transcriptional regulator, IclR family  32.52 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.27 
 
 		 255 aa  72  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0896  transcriptional regulator  50.77 
 
 		 91 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  26.91 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  25.45 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  27.52 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.36 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  28.28 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  26.7 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  26.72 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  24 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2809  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2609  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  0.0160268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2383  transcriptional regulator, IclR family  27.17 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5944  transcriptional regulator, IclR family  27.32 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  30.56 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  30.14 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1929  transcriptional regulator, IclR family  30.84 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  25.1 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  25.1 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  28.06 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  25.1 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  26.79 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  25.1 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  25.1 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  25.1 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  25.1 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0340  IclR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3116  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.5 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3216  IclR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  28.91 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.5 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.98 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  26.98 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4050  regulatory protein, IclR  27.27 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  24.51 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  28.14 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1099  transcriptional regulator, IclR family  32.08 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  30.46 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  28.05 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  28.28 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  25.83 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  25.4 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  27.41 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  25.4 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2154  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  25.4 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  25.4 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  25.4 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  28.9 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  26.72 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1796  IclR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>