222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5944 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5944  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4448  IclR family transcriptional regulator  54.88 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4050  regulatory protein, IclR  55.37 
 
 		 262 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38610  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0846  transcriptional regulator, IclR family  36.62 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.731072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3768  regulatory proteins, IclR  37.2 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000320776  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21340  transcriptional regulator  34.22 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1748  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0663  transcriptional regulator, IclR family  35.1 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0572  transcriptional regulator, IclR family  27.11 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  25.21 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1951  transcriptional regulator, IclR family  27.11 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  32.84 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  27.13 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  29.82 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.07 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  24.44 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  30.28 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0897  regulatory proteins, IclR  27.32 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0578  IclR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  22.67 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1301  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 		 880 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  26.24 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  22.62 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  25.73 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  25.41 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1929  transcriptional regulator, IclR family  27.88 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0896  transcriptional regulator  47.3 
 
 		 91 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  24.64 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  26.22 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  24.33 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 550 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  25.7 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  26.89 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  29.46 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  25.88 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  21.3 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  31.1 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  24.89 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  28.64 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  24.89 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  25 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  24.89 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4954  transcriptional regulator, IclR family  26.87 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  25.46 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  23.67 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  28 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  23.67 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  23.67 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  23.67 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  23.67 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  25.89 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  29.58 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  25.54 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  27.67 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 325 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  21.7 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  21.7 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  21.7 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  21.7 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  21.7 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  21.7 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  21.7 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  21.7 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  26.05 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 259 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 251 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  26.13 
 
 		 294 aa  52.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0667  regulatory protein IclR  26.09 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  23.48 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  22.9 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 250 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1022  Transcriptional regulator IclR  28.44 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 295 aa  52  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 254 aa  52.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  29.21 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>