More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1301 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1301  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
880 aa  1780    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1587  transcriptional regulator, IclR family  60.61 
 
 
835 aa  965    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0088004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  53.82 
 
 
627 aa  670    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  48.63 
 
 
636 aa  612  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  44.61 
 
 
632 aa  549  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  43.88 
 
 
626 aa  531  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  45.2 
 
 
629 aa  526  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2047  acetyl-coenzyme A synthetase  43.67 
 
 
651 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1767  AMP-dependent synthetase and ligase  43.51 
 
 
650 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898058  normal  0.363453 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  43.89 
 
 
632 aa  529  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  43.51 
 
 
631 aa  525  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  43.28 
 
 
629 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  44.15 
 
 
632 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  44.99 
 
 
635 aa  514  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  43.25 
 
 
639 aa  510  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  44.17 
 
 
631 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  41.64 
 
 
629 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  42.9 
 
 
639 aa  504  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  42.68 
 
 
625 aa  502  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  40.49 
 
 
650 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  43.43 
 
 
629 aa  491  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  40.56 
 
 
650 aa  485  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  41.48 
 
 
652 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  41.15 
 
 
655 aa  473  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  42.16 
 
 
651 aa  472  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  41.97 
 
 
648 aa  464  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  40.6 
 
 
638 aa  465  1e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  40.67 
 
 
666 aa  457  1e-127  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  40.53 
 
 
670 aa  456  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  38.77 
 
 
660 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  41.35 
 
 
638 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  39.41 
 
 
657 aa  451  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  38.74 
 
 
666 aa  451  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  39.8 
 
 
636 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  40.03 
 
 
664 aa  451  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  39.54 
 
 
667 aa  452  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  40.38 
 
 
648 aa  450  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  38.85 
 
 
636 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  40.44 
 
 
656 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  40.32 
 
 
649 aa  449  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  40.49 
 
 
656 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  40.16 
 
 
644 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  40.32 
 
 
667 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  40.36 
 
 
652 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  38.99 
 
 
636 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  39.8 
 
 
667 aa  445  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  40.69 
 
 
659 aa  445  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  39.34 
 
 
660 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  40.69 
 
 
652 aa  445  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  39.38 
 
 
666 aa  446  1e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  40.89 
 
 
667 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  38.29 
 
 
631 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  39.28 
 
 
652 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  38.64 
 
 
667 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  38.96 
 
 
649 aa  442  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  37.37 
 
 
653 aa  438  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  41.77 
 
 
651 aa  438  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  39.53 
 
 
643 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  40.85 
 
 
655 aa  437  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  37.66 
 
 
631 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  38.87 
 
 
659 aa  438  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  37.85 
 
 
632 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  39.64 
 
 
655 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  37.68 
 
 
632 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  39.09 
 
 
656 aa  435  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2222  acetate--CoA ligase  41.03 
 
 
648 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  39.62 
 
 
656 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  39.31 
 
 
655 aa  432  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3790  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 
633 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.20899  decreased coverage  0.0016859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  38.28 
 
 
664 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  39.35 
 
 
663 aa  430  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  39.64 
 
 
649 aa  432  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  39.33 
 
 
668 aa  432  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0706  acetate/CoA ligase  38.64 
 
 
663 aa  431  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  38.61 
 
 
660 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  39.31 
 
 
655 aa  432  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  38.28 
 
 
664 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  39.23 
 
 
657 aa  432  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  38.47 
 
 
655 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  38.77 
 
 
652 aa  427  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  39.53 
 
 
656 aa  428  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  39.1 
 
 
657 aa  429  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  39.57 
 
 
657 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  39.27 
 
 
661 aa  429  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  38.98 
 
 
652 aa  427  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  38.61 
 
 
650 aa  429  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  37.5 
 
 
658 aa  428  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  40.52 
 
 
658 aa  425  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  38.46 
 
 
649 aa  425  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  39.94 
 
 
656 aa  425  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  38.75 
 
 
663 aa  425  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  40.3 
 
 
661 aa  426  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  39.87 
 
 
670 aa  421  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  36.71 
 
 
653 aa  420  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1386  AMP-dependent synthetase and ligase  39.45 
 
 
626 aa  421  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.911526 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  38.24 
 
 
658 aa  422  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  38.16 
 
 
660 aa  422  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0420  AMP-dependent synthetase and ligase  40.55 
 
 
629 aa  420  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0761365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  39.4 
 
 
660 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0250  AMP-dependent synthetase and ligase  40.72 
 
 
629 aa  422  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>