More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1941 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1941  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 280 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383079  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0194  transcriptional regulator, IclR family  76.78 
 
 		 292 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0903072  decreased coverage  0.000072825 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0978  IclR family transcriptional regulator  74.91 
 
 		 292 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0639197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0713  IclR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152863 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0203  IclR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.670577 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7131  IclR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 254 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  31.36 
 
 		 269 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 273 aa  119  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  32.95 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 259 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.08 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.87 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.02 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  30.63 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  30.93 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.17 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  31.05 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  31.77 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  31.02 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.02 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6222  IclR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.02 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  31.02 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  33.05 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.02 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.87 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  32.43 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.02 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.02 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.02 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  29.29 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  32.8 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  27.98 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  29.37 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  27.78 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0697  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.734635  decreased coverage  0.00216711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  28.4 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  27.87 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  29.05 
 
 		 267 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0565  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.74 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0570  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.74 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0624  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.74 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  27.17 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0563  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.74 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  27.59 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  28.02 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  27.16 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  29.86 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 250 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 255 aa  99.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  27.69 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 273 aa  99.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  26.92 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  27.35 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  26.92 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  26.92 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  26.92 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  26.92 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 250 aa  99  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 250 aa  98.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  29.77 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  31.87 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  28.19 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  27.69 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  31.87 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>