28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0905 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  65.91 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  64.09 
 
 		 220 aa  234  6e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  46.25 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  32.09 
 
 		 292 aa  68.2  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0990  regulatory protein, ArsR  48.53 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.683159  hitchhiker  0.00169297 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  38.33 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1395  Fis family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  47.92 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.23 
 
 		 118 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  53.06 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  52.08 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 		 88 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1862  Fis family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 87 aa  51.2  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 		 120 aa  51.2  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 86 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 112 aa  48.1  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 		 115 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 120 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  37.14 
 
 		 102 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  35.71 
 
 		 120 aa  45.8  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  42.4  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 87 aa  42  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0860  regulatory protein, ArsR  30.26 
 
 		 114 aa  41.6  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>