27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1759 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  91.04 
 
 
134 aa  255  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  56.92 
 
 
132 aa  164  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  57.48 
 
 
135 aa  158  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  39 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  40.21 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  36.7 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  36.62 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  49.02 
 
 
220 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
219 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
223 aa  53.5  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  46.43 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
79 aa  50.8  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  45.28 
 
 
292 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0860  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1272  hypothetical protein  38.18 
 
 
198 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.658952 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  32.91 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  33.68 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  38 
 
 
212 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  37.21 
 
 
143 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>