47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0860 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0860  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 114 aa  222  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  34.95 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  38.98 
 
 		 385 aa  51.2  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  38.57 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  36.14 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  35.21 
 
 		 266 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  34.29 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  34.29 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  34.29 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  34.29 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  32.26 
 
 		 253 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  32.86 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  30.23 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 112 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  31.34 
 
 		 243 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 134 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  30.16 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  34.29 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  31.34 
 
 		 244 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.29 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  34.33 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1969  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 174 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  28.57 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  30.21 
 
 		 104 aa  40  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 109 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>