25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0495 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 132 aa  259  1e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  60.77 
 
 		 134 aa  167  4e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  56.92 
 
 		 134 aa  164  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  57.89 
 
 		 135 aa  161  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  41.13 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  41.51 
 
 		 118 aa  84.7  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  41.75 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  33.88 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  49.02 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 98 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  47.17 
 
 		 292 aa  47.4  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0860  regulatory protein, ArsR  40.38 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  38.18 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1272  hypothetical protein  35.85 
 
 		 198 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.658952 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0990  regulatory protein, ArsR  46 
 
 		 83 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.683159  hitchhiker  0.00169297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  33.9 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 		 111 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>