37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0412 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  100 
 
 		 118 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  68.1 
 
 		 120 aa  169  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  64.1 
 
 		 120 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  71.3 
 
 		 120 aa  157  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  41.96 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  41.51 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  39 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  39.13 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  31.34 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  31.34 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0717  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.797937 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  42.55 
 
 		 292 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1272  hypothetical protein  32.43 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.658952 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1575  paREP10  46.81 
 
 		 54 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3317  regulatory protein, ArsR  40.85 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0899623 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  50 
 
 		 254 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0606  paREP10  48.84 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0811  paREP10  45.95 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  46.94 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  37.66 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  42.55 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>