106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2904 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 89 aa  177  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0717  regulatory protein, ArsR  53.16 
 
 		 81 aa  92.8  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.797937 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1369  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1684  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  46.3 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0453  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.701032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  27.38 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1699  regulatory protein ArsR  45.1 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  27.84 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.89 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  28.05 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  28.77 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 339 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  36.51 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 503 aa  44.3  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  45.28 
 
 		 212 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  28.36 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 219 aa  43.5  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  32 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  42.59 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0140  Fis family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  46.94 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  25.29 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0202  ArsR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 100 aa  42  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  32.35 
 
 		 358 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  35.85 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  26.58 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2804  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.30723  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2001  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 387 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1970  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 109 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 117 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  30.99 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1509  transcriptional regulator, ArsR family  25.97 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0832432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  27.16 
 
 		 113 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 118 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  28.99 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0682  transcriptional regulator, ArsR family  32.31 
 
 		 97 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 		 151 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  30.65 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  34.43 
 
 		 266 aa  41.2  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  27.71 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  30.16 
 
 		 120 aa  40.8  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  28.36 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  28.99 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1313  ArsR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  34.55 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  31.94 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 224 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  27.16 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  29.33 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  33.9 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  29.33 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  28.81 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 231 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 123 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  30.67 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  31.48 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  23.53 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4734  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 		 118 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  41.38 
 
 		 285 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>