14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1509 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1509  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 93 aa  188  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0832432 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2804  transcriptional regulator, ArsR family  65.93 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.30723  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1531  putative transcriptional regulator  59.34 
 
 		 114 aa  115  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0951633  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2818  putative transcriptional regulator  54.95 
 
 		 91 aa  106  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  49.47 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1970  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0202  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1313  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1684  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1699  regulatory protein ArsR  36.67 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1369  regulatory protein ArsR  34.48 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0453  putative transcriptional regulator  32.22 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.701032 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  25.97 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0717  regulatory protein, ArsR  44.64 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.797937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>