17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1970 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1970  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 109 aa  224  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1684  transcriptional regulator, ArsR family  54.08 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1313  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1509  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0832432 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0202  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2804  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.30723  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1699  regulatory protein ArsR  44.87 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1531  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0951633  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2818  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0453  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.701032 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1369  regulatory protein ArsR  35.96 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 89 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0717  regulatory protein, ArsR  30.3 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.797937 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>