35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0717 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0717  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 81 aa  165  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.797937 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  53.16 
 
 		 89 aa  92.8  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1699  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  44.12 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2804  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.30723  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 350 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  32 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5737  ArsR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 108 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.303432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 121 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5449  ArsR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 108 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5359  ArsR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 108 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  29.23 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  40.82 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  29.23 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  28.21 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1348  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208543  normal  0.0554096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1970  regulatory protein, ArsR  30.3 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1509  transcriptional regulator, ArsR family  44.64 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0832432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  38.33 
 
 		 330 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  38.6 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2818  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 112 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  32.79 
 
 		 123 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 339 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>