21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2804 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2804  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
92 aa  187  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.30723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1509  transcriptional regulator, ArsR family  65.93 
 
 
93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0832432 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1531  putative transcriptional regulator  54.95 
 
 
114 aa  106  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0951633  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  48.31 
 
 
96 aa  98.2  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2818  putative transcriptional regulator  48.35 
 
 
91 aa  97.1  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215326  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0202  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1699  regulatory protein ArsR  40 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1970  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1313  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1684  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1369  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0453  putative transcriptional regulator  32.1 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.701032 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0140  Fis family transcriptional regulator  44.26 
 
 
181 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0129  regulatory protein, ArsR  44.26 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0717  regulatory protein, ArsR  37.1 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.797937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
192 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 
182 aa  41.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>