191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1231 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0166  ArsR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 184 aa  92  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.789061  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0140  Fis family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 181 aa  84.3  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0129  regulatory protein, ArsR  38.73 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1560  regulatory protein ArsR  46.84 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.964745  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0967  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1661  regulatory protein ArsR  43.04 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.921991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0252  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  39.71 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 102 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  31.68 
 
 		 115 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 171 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 112 aa  51.2  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 89 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  29.11 
 
 		 110 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  49.3  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  31.08 
 
 		 110 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 		 93 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  36.49 
 
 		 307 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 312 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 326 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1254  hypothetical protein  43.64 
 
 		 136 aa  48.1  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  31.52 
 
 		 125 aa  48.1  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  28.95 
 
 		 100 aa  48.1  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 326 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 126 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 120 aa  48.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 113 aa  47.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 326 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 95 aa  47.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  30 
 
 		 95 aa  47.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1552  hypothetical protein  30.95 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 97 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 307 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 120 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 85 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 120 aa  47.4  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  32.88 
 
 		 92 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1526  putative transcriptional regulator  39.06 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 95 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 106 aa  47.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  27.94 
 
 		 115 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 120 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  41.18 
 
 		 112 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 348 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  42.62 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3025  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 347 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.775096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  27.94 
 
 		 115 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2324  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 94 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  27.94 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 129 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 127 aa  45.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3114  hypothetical protein  41.82 
 
 		 137 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 112 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  28.95 
 
 		 111 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  38.46 
 
 		 306 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  32.81 
 
 		 113 aa  45.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  28.95 
 
 		 111 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 124 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 355 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2783  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 346 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.242907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3026  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 347 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.775949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  34.33 
 
 		 114 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 86 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 230 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 437 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 322 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 121 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2727  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 347 aa  45.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0462695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2708  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 347 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 119 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2985  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 347 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000023297 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1499  transcriptional regulator, TrmB  34.48 
 
 		 132 aa  45.1  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2990  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 347 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2778  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 347 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2989  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 347 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 115 aa  44.7  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 117 aa  44.7  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 334 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  35.29 
 
 		 113 aa  44.7  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  30.99 
 
 		 122 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2254  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 347 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.205075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  36.51 
 
 		 110 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 101 aa  44.7  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  32 
 
 		 101 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 		 106 aa  44.3  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  32 
 
 		 101 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  32 
 
 		 101 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  32 
 
 		 101 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2836  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  32 
 
 		 101 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 		 105 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 309 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>