15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3114 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3114  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  285  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2836  hypothetical protein  94.89 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1254  hypothetical protein  87.41 
 
 		 136 aa  249  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1552  hypothetical protein  79.26 
 
 		 137 aa  228  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3355  hypothetical protein  76.87 
 
 		 137 aa  228  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.811536  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2667  putative transcriptional regulator  47.79 
 
 		 136 aa  137  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3257  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0161  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.961191  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4321  hypothetical protein  31.15 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3159  hypothetical protein  28.79 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.614847 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  41.82 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 116 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2381  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2427  regulatory protein MarR  40.68 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.753969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>