15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1254 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1254  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  280  4.0000000000000003e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3114  hypothetical protein  87.41 
 
 
137 aa  249  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2836  hypothetical protein  85.19 
 
 
137 aa  242  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1552  hypothetical protein  85.19 
 
 
137 aa  237  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3355  hypothetical protein  77.61 
 
 
137 aa  228  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.811536  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2667  putative transcriptional regulator  52.63 
 
 
136 aa  142  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3257  putative transcriptional regulator  48.78 
 
 
134 aa  133  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0161  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 
158 aa  72  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.961191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3159  hypothetical protein  31.62 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.614847 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4321  hypothetical protein  27.87 
 
 
212 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  32.97 
 
 
182 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2102  transcriptional regulator  30.21 
 
 
289 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.697253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0222  ferric-uptake regulator  34.38 
 
 
139 aa  40.4  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>