132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3558 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 97 aa  189  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  43.62 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  42.71 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  36.05 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  35.48 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9201  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  30.49 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1455  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  30.68 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  26.6 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8713  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0202623  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 218 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1707  ArsR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000753333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  38.36 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 221 aa  47.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1719  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  36.67 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  47.46 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  37.29 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 194 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 223 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  39.68 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  43.4 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  48 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 222 aa  43.9  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 437 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  52.08 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 253 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 329 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  30.51 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  37.7 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  41.51 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2001  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 387 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  34.43 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  27.17 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  43.14 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  37.25 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 118 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  51.11 
 
 		 249 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 102 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 226 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 192 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  29.69 
 
 		 110 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  48 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  28.42 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  32.69 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0229  regulatory protein, ArsR  29.87 
 
 		 110 aa  40.8  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00808889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  40.35 
 
 		 339 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>