49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0140 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0140  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  360  5.0000000000000005e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0129  regulatory protein, ArsR  84.71 
 
 		 157 aa  268  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0967  ArsR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  47.78 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1560  regulatory protein ArsR  39.78 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.964745  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0166  ArsR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.789061  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0252  ArsR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1661  regulatory protein ArsR  37.17 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.921991 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 120 aa  50.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 114 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  40.68 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2804  transcriptional regulator, ArsR family  44.26 
 
 		 92 aa  47.8  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.30723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 113 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 115 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 		 121 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 		 135 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 125 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2783  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 346 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.242907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3026  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 347 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.775949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2254  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 347 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.205075 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2990  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 347 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5584  transcriptional regulator, TrmB  43.33 
 
 		 307 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.107073 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0111  regulatory protein ArsR  36.92 
 
 		 260 aa  43.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0376512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2985  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 347 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000023297 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2989  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 347 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2708  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 347 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2727  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 347 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0462695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2778  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 347 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 89 aa  43.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 117 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0780  conserved hypothetical protein  34.57 
 
 		 100 aa  42.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.482824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 		 114 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 120 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1369  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 111 aa  42  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 		 86 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  35.94 
 
 		 107 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 107 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  39.58 
 
 		 93 aa  42  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 		 127 aa  42  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 124 aa  41.6  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 108 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3025  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 347 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.775096  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 234 aa  41.6  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  29.03 
 
 		 123 aa  41.2  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 132 aa  41.2  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 317 aa  40.8  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>