12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0780 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0780  conserved hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  200  6e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.482824  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1573  hypothetical protein  48.19 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0939  hypothetical protein  34.25 
 
 
85 aa  50.8  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0341547  hitchhiker  0.000571879 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0027  hypothetical protein  32.88 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0279  conserved hypothetical protein  37.33 
 
 
96 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2076  hypothetical protein  35.62 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00255603  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0140  Fis family transcriptional regulator  34.57 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1258  hypothetical protein  30.34 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0254371  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0902  hypothetical protein  34.94 
 
 
83 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0129  regulatory protein, ArsR  31.94 
 
 
157 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0330  hypothetical protein  30.26 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000040093  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0651  hypothetical protein  29.41 
 
 
86 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>