17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1573 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1573  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  179  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0116565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0780  conserved hypothetical protein  50.63 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.482824  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0279  conserved hypothetical protein  41.49 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0027  hypothetical protein  38.67 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0939  hypothetical protein  35.06 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0341547  hitchhiker  0.000571879 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1057  hypothetical protein  33.77 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.875371 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1267  hypothetical protein  40.7 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.751557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2076  hypothetical protein  39.24 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00255603  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0902  hypothetical protein  37.18 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0718  hypothetical protein  32.05 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.965129  hitchhiker  0.000000000542422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0330  hypothetical protein  30.67 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000040093  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0651  hypothetical protein  28.57 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1446  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0631  hypothetical protein  35.44 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.345697  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1376  hypothetical protein  36.62 
 
 		 93 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000415589  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1157  hypothetical protein  36.62 
 
 		 93 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000220051  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  31.48 
 
 		 258 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>