13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1446 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1446  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  189  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1426  hypothetical protein  41.05 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0033  hypothetical protein  36.9 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1057  hypothetical protein  32.18 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.875371 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0718  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.965129  hitchhiker  0.000000000542422 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0939  hypothetical protein  28.74 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0341547  hitchhiker  0.000571879 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0027  hypothetical protein  28.74 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0631  hypothetical protein  30.68 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.345697  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0142  hypothetical protein  28.26 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0651  hypothetical protein  31.03 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0902  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1573  hypothetical protein  36.47 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
193 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>