12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2076 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2076  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  210  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00255603  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0902  hypothetical protein  37.66 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1267  hypothetical protein  37.88 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.751557  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0187  hypothetical protein  40.62 
 
 
88 aa  48.1  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.249971  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0279  conserved hypothetical protein  34.33 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0780  conserved hypothetical protein  35.62 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.482824  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1057  hypothetical protein  41.1 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.875371 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0939  hypothetical protein  32.43 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0341547  hitchhiker  0.000571879 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0027  hypothetical protein  36.51 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0330  hypothetical protein  42.86 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000040093  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1573  hypothetical protein  38.1 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1187  hypothetical protein  44.9 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00137424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>