12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1267 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1267  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  214  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.751557  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0279  conserved hypothetical protein  40.22 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0939  hypothetical protein  36.62 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0341547  hitchhiker  0.000571879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2076  hypothetical protein  37.88 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00255603  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1057  hypothetical protein  40.85 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.875371 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0902  hypothetical protein  40.58 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0027  hypothetical protein  38.03 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0187  hypothetical protein  36.47 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.249971  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0718  hypothetical protein  36.76 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.965129  hitchhiker  0.000000000542422 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1258  hypothetical protein  34.15 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0254371  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0651  hypothetical protein  35.29 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0330  hypothetical protein  38.57 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000040093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>