29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0129 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0129  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 157 aa  313  6e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0140  Fis family transcriptional regulator  84.71 
 
 		 181 aa  268  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1560  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.964745  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0967  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  38.73 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0166  ArsR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.789061  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1661  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.921991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0252  ArsR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 115 aa  47.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2804  transcriptional regulator, ArsR family  44.26 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.30723  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2405  ArsR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.673414  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  37.66 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3485  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 121 aa  42.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 85 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 108 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0328  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.018451 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0780  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 		 100 aa  42  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.482824  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  29.85 
 
 		 105 aa  41.2  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 107 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  34.38 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0506  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1182  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00795875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>