61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1182 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1182  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
99 aa  190  6e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00795875  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0229  regulatory protein, ArsR  52.22 
 
 
110 aa  97.4  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00808889 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  34.78 
 
 
310 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  34.15 
 
 
306 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0749  FHA domain-containing protein  34.94 
 
 
256 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  33.82 
 
 
106 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  33.82 
 
 
106 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1526  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  38.98 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  35.09 
 
 
184 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  32.1 
 
 
358 aa  43.9  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4734  regulatory protein, ArsR  30.43 
 
 
118 aa  43.5  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194838  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
226 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  35.59 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0873  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.107087  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0129  regulatory protein, ArsR  32.14 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
132 aa  42.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  32 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  42.86 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  35.59 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
115 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
105 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
106 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 
116 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  35.09 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  25.77 
 
 
171 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  38.46 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  36.54 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
93 aa  40.8  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
222 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1102  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 
304 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2186  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000631011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 
87 aa  40.8  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  25.37 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0140  Fis family transcriptional regulator  29.76 
 
 
181 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  23.91 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  27.63 
 
 
322 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  30.23 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  25.86 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  32.43 
 
 
101 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0479  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 
114 aa  40  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  25.37 
 
 
109 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4216  transcriptional regulator, TrmB  40.98 
 
 
200 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.141181  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4238  ArsR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
358 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499229  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
99 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
125 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
99 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>