27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0328 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0328  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
107 aa  211  1.9999999999999998e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.018451 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0184  regulatory protein, ArsR  95.33 
 
 
107 aa  205  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.678955  normal  0.871584 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0188  ArsR family transcriptional regulator  80.23 
 
 
86 aa  140  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2840  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1352  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.182081  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  32.95 
 
 
120 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  31.82 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4890  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.040811  normal  0.40753 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0916  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  25 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  25.29 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3014  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  25.29 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0765911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  30.68 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  30.85 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  37.5 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  29.41 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0953  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  51.16 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0166  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.789061  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  24.72 
 
 
96 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5889  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 
307 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0129  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
157 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  29.55 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0022  hypothetical protein  35 
 
 
203 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.556429  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  30.21 
 
 
106 aa  40.8  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  41.82 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  41.82 
 
 
112 aa  40  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>