More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2405 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2405  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  219  8e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.673414  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  47.52 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  42.59 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  49.04 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0423  regulatory protein, ArsR  49.47 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0873  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.107087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  44.26 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  40.85 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  42.03 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3344  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0506  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  45 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  45 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  45 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 342 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  32.5 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  45 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  45 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  45 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 		 337 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  32.5 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  43.33 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  45 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  36.49 
 
 		 349 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  39.44 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 354 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3443  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3444  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  32.05 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  38.67 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  41.67 
 
 		 101 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  31.51 
 
 		 336 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  38.33 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  35.71 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  31.25 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  35.59 
 
 		 90 aa  50.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  39.44 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.08 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1931  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  29.07 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  40.68 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  30.38 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1812  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>