63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0166 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0166  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.789061  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  42.53 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1560  regulatory protein ArsR  35.58 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.964745  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0129  regulatory protein, ArsR  32.43 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0967  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0140  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0252  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  35.82 
 
 
306 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1661  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 
181 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.921991 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
317 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  26.39 
 
 
349 aa  48.9  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
305 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  29.87 
 
 
309 aa  48.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
307 aa  47.8  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
134 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
328 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
115 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
114 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
323 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  30.16 
 
 
305 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  30.16 
 
 
307 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
339 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1526  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  28.77 
 
 
328 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  31.88 
 
 
112 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
337 aa  45.1  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  27.87 
 
 
105 aa  45.1  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
327 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
307 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
317 aa  44.7  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  32.35 
 
 
105 aa  44.7  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
329 aa  44.7  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  27.17 
 
 
310 aa  44.7  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  27.94 
 
 
312 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  33.9 
 
 
100 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1099  ArsR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
359 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967799  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  27.27 
 
 
117 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  28 
 
 
115 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 
342 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  26.67 
 
 
311 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
341 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
107 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
349 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  34.21 
 
 
107 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  28.77 
 
 
92 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0328  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
107 aa  42.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.018451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 
354 aa  42.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
118 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  30.77 
 
 
114 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  30.65 
 
 
112 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2846  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 
184 aa  41.6  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  29.03 
 
 
324 aa  42  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
114 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
348 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  24.72 
 
 
310 aa  41.6  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  23.96 
 
 
119 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 
103 aa  41.2  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
129 aa  41.6  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
258 aa  41.2  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1527  regulatory protein ArsR  29.85 
 
 
104 aa  41.2  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0617879  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
108 aa  41.2  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 
341 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
110 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>