74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_20640 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  100 
 
 
310 aa  637    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5706  hypothetical protein  44.07 
 
 
295 aa  289  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  45.27 
 
 
306 aa  285  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5584  transcriptional regulator, TrmB  43.97 
 
 
307 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.107073 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1102  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5889  transcriptional regulator, ArsR family  42.07 
 
 
307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6802  transcriptional regulator, ArsR family  42.07 
 
 
307 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  42.23 
 
 
300 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  40.33 
 
 
322 aa  253  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0229  regulatory protein, ArsR  30.68 
 
 
110 aa  55.8  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00808889 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  39.66 
 
 
119 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  41.07 
 
 
99 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 
103 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
192 aa  49.7  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  38.6 
 
 
130 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  37.29 
 
 
137 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  34.33 
 
 
104 aa  49.3  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1182  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 
99 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00795875  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
219 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
86 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  36.21 
 
 
100 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  35.59 
 
 
136 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  33.9 
 
 
141 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  45.28 
 
 
113 aa  46.2  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
115 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
112 aa  46.2  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  31.08 
 
 
93 aa  45.8  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  31.67 
 
 
328 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
105 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  35.38 
 
 
110 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
85 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 
106 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  36.07 
 
 
100 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  27.91 
 
 
131 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  34.67 
 
 
116 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  34.43 
 
 
101 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
196 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
103 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
503 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  32.53 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  35.09 
 
 
105 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 
115 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 
194 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
349 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1286  transcriptional regulator, ArsR family/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  36.92 
 
 
244 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287938  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 
120 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
329 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.59 
 
 
121 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  35.48 
 
 
339 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
349 aa  43.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
339 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  31.67 
 
 
342 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  31.67 
 
 
354 aa  43.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
327 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  31.03 
 
 
112 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
111 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  38.6 
 
 
123 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  30.36 
 
 
117 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
151 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  36.36 
 
 
113 aa  43.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  33.87 
 
 
93 aa  42.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
151 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  32.79 
 
 
100 aa  42.7  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
132 aa  42.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
348 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
127 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
118 aa  42.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
117 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
138 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
109 aa  42.4  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  29.85 
 
 
124 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
307 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>