17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5584 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5584  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 307 aa  628  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.107073 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5706  hypothetical protein  67.01 
 
 		 295 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  56.54 
 
 		 306 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5889  transcriptional regulator, ArsR family  57 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6802  transcriptional regulator, ArsR family  56.35 
 
 		 307 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  43.97 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  41.58 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  41.72 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1102  transcriptional regulator, ArsR family  40.34 
 
 		 304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 		 209 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 110 aa  46.2  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2994  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 98 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0140  Fis family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 181 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0048  transcriptional regulator, ArsR family protein  39.22 
 
 		 92 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0663056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  28.57 
 
 		 100 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0229  regulatory protein, ArsR  31.91 
 
 		 110 aa  42.7  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00808889 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 96 aa  42.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>