22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1369 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1369  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 111 aa  230  4.0000000000000004e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1699  regulatory protein ArsR  46.99 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0202  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1684  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1509  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0832432 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1313  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0453  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.701032 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1531  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0951633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1970  regulatory protein, ArsR  35.96 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2818  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2804  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.30723  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  41.07 
 
 		 215 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  41.18 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  41.18 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  29.89 
 
 		 129 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0140  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  29.17 
 
 		 112 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  31.94 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>