31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3387 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1509  transcriptional regulator, ArsR family  49.47 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0832432 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2804  transcriptional regulator, ArsR family  48.31 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.30723  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0202  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1531  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0951633  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1699  regulatory protein ArsR  44.68 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2818  putative transcriptional regulator  41.57 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1313  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1970  regulatory protein, ArsR  47.67 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1684  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1369  regulatory protein ArsR  42.67 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0453  putative transcriptional regulator  36.26 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.701032 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 192 aa  51.6  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 130 aa  48.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  37.7 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.211312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5389  transcriptional regulator, ArsR family  29.76 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0717  regulatory protein, ArsR  28.21 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.797937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8615  transcriptional regulator, ArsR family  26.37 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00863901  normal  0.187471 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 368 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  28.99 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  28.99 
 
 		 86 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  29.11 
 
 		 113 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0612  ArsR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 204 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 119 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 368 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>