21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0202 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0202  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 100 aa  203  7e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1313  ArsR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1684  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1531  putative transcriptional regulator  37.78 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0951633  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1699  regulatory protein ArsR  47.5 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1509  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0832432 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1970  regulatory protein, ArsR  43.02 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2804  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.30723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2818  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1369  regulatory protein ArsR  45.71 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0453  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.701032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  29.07 
 
 		 112 aa  43.9  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 89 aa  42  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 120 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>