19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1699 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1699  regulatory protein ArsR  100 
 
 
123 aa  241  3e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1369  regulatory protein ArsR  46.99 
 
 
111 aa  84  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0202  ArsR family transcriptional regulator  47.5 
 
 
100 aa  84  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1684  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2804  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
92 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.30723  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0453  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.701032 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1313  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1970  regulatory protein, ArsR  44.87 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1509  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0832432 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1531  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0951633  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2818  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 
91 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215326  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0717  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.797937 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  27.59 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  35.44 
 
 
203 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1491  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>