13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1313 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1313  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  260  4e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0202  ArsR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1970  regulatory protein, ArsR  43.48 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1684  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1509  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0832432 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1531  putative transcriptional regulator  39.33 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0951633  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1699  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2818  putative transcriptional regulator  37.08 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2804  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.30723  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1369  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0453  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.701032 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  29.87 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>