19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2818 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2818  putative transcriptional regulator  100 
 
 
91 aa  187  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215326  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1531  putative transcriptional regulator  65.93 
 
 
114 aa  130  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0951633  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1509  transcriptional regulator, ArsR family  54.95 
 
 
93 aa  106  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0832432 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2804  transcriptional regulator, ArsR family  48.35 
 
 
92 aa  97.1  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.30723  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 
96 aa  89.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0202  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1313  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1970  regulatory protein, ArsR  35.56 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1369  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 
111 aa  61.6  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1699  regulatory protein ArsR  31.11 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1684  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0453  putative transcriptional regulator  31.46 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.701032 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
503 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0612  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
305 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
228 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 
223 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.211312 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0717  regulatory protein, ArsR  29.85 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.797937 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>