59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0909 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0612  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  47.26 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.211312 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0588  transcriptional regulator, MarR family  68.6 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2977  transcriptional regulator, ArsR family  67.44 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381665  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3005  transcriptional regulator, MarR family  35.32 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00979308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1711  regulatory protein, ArsR  51.95 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1236  ArsR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.348841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2633  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2059  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1567  regulatory protein, ArsR  52.11 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0682  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 97 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 97 aa  52.4  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  32.05 
 
 		 105 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 		 105 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 117 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 134 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 123 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 109 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 107 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 121 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 105 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  40.68 
 
 		 124 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 116 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 121 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  34 
 
 		 101 aa  45.8  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 110 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 110 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 485 aa  45.1  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1264  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00305286  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 122 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5809  transcriptional regulator, ArsR family  34.33 
 
 		 112 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522753  normal  0.488777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 116 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 122 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9201  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 122 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 109 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 437 aa  42.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 111 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 		 118 aa  42.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 113 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 106 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 106 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 112 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 		 97 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  33.93 
 
 		 120 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  35.96 
 
 		 104 aa  42  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 		 107 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  35 
 
 		 117 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 114 aa  41.6  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 106 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 106 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 106 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 106 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 121 aa  41.6  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>