92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_3005 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_3005  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00979308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  62.67 
 
 		 218 aa  270  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0588  transcriptional regulator, MarR family  58.14 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  54.93 
 
 		 223 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.211312 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2977  transcriptional regulator, ArsR family  53.49 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0612  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2633  ArsR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1567  regulatory protein, ArsR  33.02 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1711  regulatory protein, ArsR  46.94 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1236  ArsR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 217 aa  91.7  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.348841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2059  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 97 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0682  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  44.26 
 
 		 105 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 117 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6743  transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.661837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 115 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  36.99 
 
 		 93 aa  48.5  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  44.64 
 
 		 188 aa  48.5  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 		 485 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 399 aa  47  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  42.68 
 
 		 101 aa  47  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 		 107 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  41.25 
 
 		 109 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 105 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 112 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 134 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 		 116 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 121 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 107 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 437 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 130 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 113 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 105 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 129 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  36.14 
 
 		 102 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  33.71 
 
 		 106 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 129 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 112 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  44.64 
 
 		 118 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 		 121 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 118 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 112 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  43.28 
 
 		 124 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 116 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 		 110 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 107 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 123 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 112 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5809  transcriptional regulator, ArsR family  38.18 
 
 		 112 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522753  normal  0.488777 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  44.64 
 
 		 118 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  44.64 
 
 		 118 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 		 108 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 		 110 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 121 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 114 aa  42.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 117 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 117 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 130 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 171 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 		 107 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 111 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3344  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 130 aa  42.4  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  32.79 
 
 		 120 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 		 86 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 		 86 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 107 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 120 aa  42  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 107 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 132 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 113 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 105 aa  42  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 113 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  34.85 
 
 		 113 aa  42  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 106 aa  41.6  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 		 111 aa  42  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 116 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 97 aa  41.6  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 116 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 		 96 aa  41.6  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 108 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 109 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>