19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1711 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1711  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 213 aa  433  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2059  transcriptional regulator, ArsR family  47.44 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1567  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 207 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2633  ArsR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1236  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.348841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  56 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.211312 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0612  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3005  transcriptional regulator, MarR family  46.94 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00979308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2977  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0588  transcriptional regulator, MarR family  53.25 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  31.65 
 
 		 120 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  30.99 
 
 		 113 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 107 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 121 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 134 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 139 aa  41.6  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 117 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>